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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

今日立春！为啥早上要先咬口萝卜？******

　　文/朱琪

　　2月4日，农历正月十四，立春。

　　立春，是二十四节气之首。立者，始也。穿越漫长的苦寒，终于迎来了春天。

　　立春，是扑面而来的温暖，从此雪消风自软，梅花合让柳条新。

　　立春，是色彩斑斓的精彩，等闲识得春风面，万紫千红总是春。

　　立春更是勃勃的生机，春风化雨，润物无声，带着对春日的盼望与期待，崭新的一年就此开始了。 

　　立春有哪些传统习俗？

　　“咬春”：也就是在早上起来先啃一口鲜脆的萝卜。明《酌中志》说：“立春之时，无贵贱嚼萝卜，曰咬春。”“咬春”取的是古人“咬得草根断，则百事可做”之意，代表一种吃得了苦、扛得住风雨的韧劲。

　　“卷春”：很多地方会在立春这天吃春饼和春卷，春卷有各种不同的做法，豆芽菜馅、豆沙馅，甜口咸口各有不同。薄薄的两张小饼卷着盎然的春意，一口咬下去，讨个好彩头。

　　“迎春”：迎春也是立春时节的一项传统习俗。按旧俗，立春前一日，由两名艺人顶冠饰带沿街高喊“春来了”，就是传统的“报春”。现在人们大多会一起出门踏青游玩，迎接春天的到来。

　　“鞭春”：又称为“打春牛”。所谓的春牛是用桑木做骨架，用土塑成的牛。立春前一日，人们会用彩鞭鞭打，男女老少牵“牛”扶“犁”，唱栽秧歌，祈求丰年。

　　立春了，如何养生？

　　关于养生，立春要注意护肝，多吃时令果蔬，补充“青色”的食物。

　　《养生论》中说，“春三月，每朝梳头一二百下”，立春开始每天坚持梳头也有很好的疏通气血作用。

　　立春之后一段时间往往冷暖不定，大家也要当心“倒春寒”侵扰，预防春季多发的呼吸道感染。

　　春日在即，希望不泯，往日已矣，来日可期。祝大家立春快乐，珍惜春光！

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）